Gregory IX创立宗座宗教裁判所；回归犹太教的皈依者现归属信仰法庭管辖

Grégoire IX 将教皇裁判所的管辖权——这一原为对付南方卡特里派异端而在罗马设立的机构——延伸至涉及犹太人的事务：并非针对犹太人本身（他们不隶属基督教信仰），而是针对那些回归犹太教的改宗者，以及收留他们的人。

这一区分看似细微，却影响深远。它将洗礼——哪怕是被迫接受的洗礼——变为一种不可解除的束缚，违背此束缚即构成死罪；同时，它将社区的内部生活置于一个无需控告即可起诉、不受上诉约束即可裁判的法庭监控之下。